محمّد بن علي بن الحسين(ع)، ملقب به باقر و کنيه ابو جعفر فرزند امام سجاد(ع) است. برخى روز تولد آن حضرت را در مدينه اول ماه رجب مصادف با روز جمعه مي دانند و برخى ديگر، سوم صفر دانسته اند. پدر ايشان امام سجّاد(ع)، پيشواي چهارم شيعيان و مادرش «ام عبدالله» دختر امام حسن مجتبي(ع) است؛ لذا هم از جهت پدري و هم از جهت مادري فاطمي و علوي است.
امام باقر(ع) در دوران امامت خويش، با وجود شرايط نامساعدي که بر عرص? فرهنگ اسلامي سايه افکنده بود، با تلاشي جدّي و گسترده نهضتي بزرگ را در زمينه علوم و معارف اسلامي طراحي کرد. تا جايي که اين جنبش دامنه دار به بنيان گذاري و تأسيس دانشگاه بزرگ و برجسته اسلامي انجاميد که پويايي و عظمت آن در دوران امام صادق(ع)، به اوج خود رسيد.
امام با برقراري حوز? درس، با کج انديشي ها مبارزه کرد و در صدد زدودن چالش هاي علمي، تحکيم مباني معارف و اصول ناب اسلامي با تکيه بر آيات رهنمون گر قرآن برآمد و ابواب فقهي و اعتقادي را از ديدگاه قرآن بررسي کرد و به پرورش دانشمندان و فرهيختگان عصر خود و جنبش بزرگ علمي پرداخت.
امام محمد باقر(ع) در حالي که 57 سال از عمر مبارکش گذشته بود، بنابر نظر مشهور مورخان در هفتم ماه ذي الحجه سال 114 هجرى ديده از جهان فرو بست و در قبرستان بقيع در کنار پدرش (امام سجاد) و عمويش (امام حسن) دفن شد. علت مرگ آن حضرت، شهادت به دستور هشام بن عبد الملک بود.